Hammerfest hadde ikke noe helsevesen i starten. Familien måtte selv stelle de syke, og ofte ble det sendt bud etter kvakksalver. Behandlingen var årelating, koppsetting, pepper, ingefær, kamfer eller brennevin.

Dansken Nils Christopher Suhr kom til Hammerfest i 1792, og han var den første legen her. Han var her i 6 år før han reiste til København for å utdanne seg videre. Han kom tilbake til Finnmark i 1800, men bosatte seg i Alta. Da han reiste sørover igjen etter 13 år var det vanskelig å få tak i ny lege.

Danmark prøvde å bygge opp et helsevesen i byen. Derfor ble det sendt opp to jordmødre til Finmark - ei til Vardø og ei til Hammerfest. Et gammelt, trekkfullt hus ute på Fuglenes ble jordmorhuset.

I 1830 årene nærmet koleraepidemien seg Finnmark og Hammerfest. Apotekene ble utstyrt med klorkalk, og det ble gitt opplysninger om sykdommen til innbyggerne. På Fuglenes ble det bygd en karantenestasjon for de som ville få kolera. Russland hadde allerede fått denne sykdommen, derfor holdt norske båter vakt, for å hindre russerne å komme til Hammerfest. En lege ble tvangsflyttet fra Alta til Hammerfest, og dette skulle nå bli hans faste bosted. Heldigvis kom koleraen aldri til byen.

I 1837 var det hele fem utdannede leger i Finnmark.